Auch die bereits für PCs gängigen Betriebssysteme sind auf PDAs beziehungsweise Smartphones anwendbar. Es wurde eigens die Version Windows CE entwickelt. Gegenüber den Windows-Betriebssystemen auf Computern, sind die Funktionen auf diesen Geräten jedoch beschränkt, da hier weniger Arbeitsspeicher zum Ausführen der Programme zur Verfügung steht. Wie EPOC und Symbian OS auch, ist Windows CE ein 32-Bit Betriebssystem. Die erste Version von Windows CE erschien 1996 am Markt.
Windows CE kann mit dem Windows mobile erweitert werden. Durch die Erweiterung können mit dem PDA bzw. dem Smartphone vielfältige Programme ausgeführt werden. Dazu gehören beispielsweise das Abspielen von Video- und Musikdateien. Office-Anwendungen wie Word und Excel können ausgeführt werden. Auch die üblichen Windowsspiele wie Minesweeper oder Solitär sind verfügbar. Viele Endnutzer hatten Probleme mit den scheinbar verschiedenen Betriebssystemen. Um Verwirrungen zu vermeiden, hat sich der Softwarehersteller dazu entschieden, die ursprüngliche Bezeichnung – Windows CE- wieder zu nutzen.